El Gakyil es la unidad básica de organización.
Coordina las actividades de la Comunidad, contando siempre con la libre colaboración de sus miembros tanto en la organización como en la realización de las actividades.
El Gakyil se compone de tres sectores que corresponden con un antiguo modelo Budista, los tres kaya de cuerpo, voz y mente. De este modo, el Gakyil simboliza el microcosmo, o el individuo, y el macrocosmo, o la sociedad.

El Gakyil para el período 2011-2012:
AMARILLO
Es el sector que representa el cuerpo, tiene el color de la tierra, amarillo, y sus componentes asumen la responsabilidad de ocuparse de los recursos administrativos y económicos que soportan a la comunidad.
Sus componentes son:
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Luz García luz_amarillo@dzogchen.es
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Sol Cañero sol_amarillo@dzogchen.es
Asistentes amarillo:
Elisenda Romera (libros)
Pepa García
Lourdes Muñoz
Eduardo Denis
ROJO
Es el sector que representa la voz, o la energía, es el rojo, el color del fuego, y sus representantes tratan con los recursos humanos y los proyectos de trabajo.
Sus componentes son:
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Javier Ruíz javier_rojo@dzogchen.es
Asistentes rojo:
Pere Iniesta
Isabel Vallejo
Ángela Mosquera
Sonia
AZUL
Es el sector relacionado con la mente, el color del espacio, el que se ocupa de las actividades relacionadas con el estudio y la meditación.
Sus componentes son:
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Olaya Martínez olaya_azul@dzogchen.es
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Núria Moreno nuria_azul@dzogchen.es
Asistentes Azul:
Elena Rocchi
Anna Diogène
Adela Moragas
Sachiko Fullita
Matthias Schmal-filius
Ester Escudero
Amparo Far
Tereñe Beltrán